生物反應(yīng)器是將原始反應(yīng)物與固定化酶和其他反應(yīng)元素在反應(yīng)容器中進(jìn)行反應(yīng)的系統(tǒng)，其中控制和管理溫度、pH、壓力等。經(jīng)過合成、分解、轉(zhuǎn)化和除去，得到所需的產(chǎn)品物質(zhì)。

1. 反應(yīng)元素

所采用的反應(yīng)要素主要有純化的酶、細(xì)胞和微生物。酶是生物體內(nèi)的催化劑，是經(jīng)典常用的反應(yīng)元素。

廣義上講，也利用植物細(xì)胞、肝細(xì)胞、血細(xì)胞等動(dòng)物細(xì)胞、線粒體、質(zhì)體等細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞器、激素受體、抗體等中發(fā)生的反應(yīng)。

2. 反應(yīng)元件的固定

固定反應(yīng)元件的主流方法是載體結(jié)合法，將反應(yīng)元件結(jié)合到不溶性載體上。其他方法包括交聯(lián)法（將反應(yīng)元素交聯(lián)在一起）和封裝法（使用封裝劑）。

通過固定反應(yīng)元件，可以更容易地將反應(yīng)元件與產(chǎn)品分離。還有一種方法，其中反應(yīng)元件不被固定而是保持浮動(dòng)。